Red de centros de secuenciación

Centros de secuenciación

Centro Nacional de Análisis Genómico

El CNAG dispone de cinco secuenciadores Illumina de segunda generación (3 NovaSeq6000, 1 HiSeq4000 y 1 MiSeq) que pueden producir hasta 10.000 gigabases (Gb) de datos de secuenciación al día. Estos equipos de secuenciación se complementan con robots de manejo de líquidos, equipos para el aislamiento de células individuales y otros. El CNAG es además pionero en el uso de tecnologías de secuenciación de tercera generación basadas en nanoporos, con varios equipos MinION, GridION y PromethION de la casa comercial Oxford Nanopore Technologies. La plataforma de secuenciación del CNAG se complementa con una potente infraestructura informática: 21 PBytes para el almacenamiento de datos (14 PB en discos y 7 PB en cintas) y más de 10.000 núcleos de procesamiento.

Contacto
  • Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG)

  • Parc Científic de Barcelona – Torre I

  • Baldiri Reixac, 4, 08028 Barcelona

  • +34 9340 37289

  • projectmanager@cnag.eu

Centro
centro-nacional
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Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica

La Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica cuenta con 7 secuenciadores de segunda generación, 5 de Illumina (1 NovaSeq 6000, 1 NextSeq 500, 1 NextSeq 550Dx y 1 MiSeq) y 2 de Ion Torrent (1 Ion GeneStudio S5 Plus y 1 Ion Genexus). Además, dispone de otro equipamiento para la preparación de muestras como robots dispensadores de líquidos, el ultrasonicador Covaris E220, sistemas de cuantificación de ADN, etc… Por otro lado, la Unidad de Secuenciación de la FPGMX cuenta con una potente infraestructura para el almacenamiento de datos y computación a través de un convenio con el Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA).

Contacto
  • Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica

  • Hospital Clínico Universitario

  • Edif. Consultas, planta -2, 15706 Santiago de Compostelaa

  • +34 981 955 191

  • info@xenomica.eu

Centro
fundacion-galega
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Nasertic-NavarraBiomed

Nasertic-NavarraBiomed cuenta con los secuenciadores de segunda generación Illumina NovaSeq 6000 e Illumina iSeq 100. Además, dispone de otros equipos auxiliares, tales como el ultrasonicador Covaris ML230 y el robot Hamilton STAR NGS, que permiten la fragmentación del DNA y el procesamiento automático de librerías de secuenciación. Por otro lado, Nasertic cuenta con la infraestructura informática necesaria para el análisis y almacenamiento de los datos genómicos generados dentro del Clúster de Supercomputación Urederra.

Contacto
  • Nasertic (Navarra de Servicios y Tecnologías)

  • C/ Orcoyen, s/n, 31011 Pamplona

  • +34 848420249

  • secuenciacion@nasertic.es

Centro
navarra-biomed
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