La infraestructura se apoya en una red de hospitales establecida a nivel nacional, que cuenta con representación de todas las Comunidades Autónomas, y en la que participan más de 100 hospitales.
Esta red de hospitales trabaja de manera coordinada. Se ha establecido un flujo de procesos diagnósticos común para el reclutamiento de pacientes, recogida de la información clínica, y realización de los estudios genómicos a través de los centros de secuenciación.
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